Introducció a la seqüenciació amb Nanopore: fonaments i anàlisis

El curs consta dels següents continguts: 

1. Introducció general. Bases. Requisits del laboratori (portabilitat). Requisits informàtics (portabilitat).

2. Avantatges i inconvenients.

• Escenaris:

1. Seqüenciació de genomes complets.
2. Reseqüenciació de zones del genoma.
3. Generació de bases de dades.
4. Amplicons.
5. Bases modificades.

3. Crida de bases (base calling) i anàlisi de dades. Format FASTQ i puntuació de qualitat (Q scores).