Introducción a la secuenciación con Nanopore: fundamentos y análisis
Programa
El curso consta de los siguientes contenidos:
1. Introducción general. Bases. Requisitos del laboratorio - portabilidad. Requisitos informáticos - portabilidad.
2. Ventajas e inconvenientes.
- Escenarios:
- Secuenciación de genomas completos.
- Resecuenciacion de zonas del genoma.
- Generación de bases de datos.
- Amplicones.
- Bases modificades.
3. Basecalling y análisis de datos. FASTQ format y Q scores.